BioNeuronCore

BioNeuronCore 是 MindCopy 平台的高性能计算引擎，用于生物真实神经网络模拟。

技术规格

• 语言： C++17 + SYCL 2020 (Intel oneAPI DPC++)
• CPU： GCC，静态库 libbiocore_gcc.a
• GPU： Intel DPC++，动态库 libbiocore_gpu_backend.so
• 数据模型： POD，#pragma pack(1)，USM 兼容

运行模式

• 交互式： 通过 SimulationBridge（IPC Unix 套接字/TCP）——用于 Studio
• 批处理： --batch --load-bion --ticks --params-json --seed --bexp-output ——用于编排器
• 作为库： 静态链接（CPU）或 dlopen（GPU）——用于直接嵌入

生物物理学

• 混合 HH+GHK：59个内置 HH 插件，所有电流通过戈德曼-霍奇金-卡茨方程计算
• 121种修饰子类型（离子通道、受体、泵、交换体、传感器）
• 扩散：菲克定律，5种离子 + 14种神经递质 + ATP + 温度
• 突触传递：化学（GPCR 级联，概率释放）+ 电（间隙连接）
• 可塑性：STDP（CaMKII/Calcineurin），BCM，PP1/DARPP-32，巩固（6个事件），基因表达（36个基因）
• 稳态：PMCA，NCX，KCC2，Na/K-ATP酶，Ca²⁺ 缓冲
• 检查点：每 N 个节拍自动保存，--resume-from，优雅关闭（SIGTERM）

BION v6 格式

二进制神经网络格式：NetworkHeader (84B)，Segment (988B)，Modifier (44B)，Synapse (824B)，Nucleus (332B)。向后兼容 v3→v4→v5→v6，支持即时迁移。

32项自动化测试。研究用途免费。